На космодромах «Плесецк», «Восточный» имеются представительства, а в г. Калуга и г. Байконур (Казахстан) работают филиалы АО «НПО Лавочкина».
Филиал на космодроме «Байконур» начало свою работу в 1965 году. За эти годы с помощью только РБ «Фрегат» были выведены на орбиту более 100 космических аппаратов.
Представительство на космодроме «Плесецк» было создано в конце 60-х годов в г. Мирный, Архангельской области. К сегодняшнему дню с участием работников базы было запущено более 100 космических аппаратов.
Строительство космодрома «Восточный» началось в 2007 году. Примерно в это же время было создано представительство АО «НПО Лавочкина» в поселке Углегорск, Амурской области.
Все представительства призваны осуществлять защиту интересов АО «НПО Лавочкина», нормальное функционирование экспедиций, контроль за поступлением, погрузкой и разгрузкой материальных ценностей.
Калужский филиал АО «НПО Лавочкина» создан в 1989 году. Он является обособленным подразделением предприятия и выполняет работы по созданию космической техники по всем темам головного предприятия.